Le plan de travail se compose de six « work packages » (WP) qui seront implémentés en collaboration avec des institutions très expérimentées : trois institutions africaines (l’une du Burkina Faso et les autres du Bénin) et deux en Europe (France et Espagne), toutes dirigées par le WP1, coordonné par l’Institut de Recherche Clinique du Bénin (IRCB). Les travaux seront menés pendant une période de 18 mois.
- Description du projetL'Organisation mondiale de la santé (OMS) a déclaré que la CoVID-19 est devenue un problème de santé mondial, provoquant de graves infections respiratoires chez l'homme pouvant conduire à la mort depuis l’apparition des premiers cas en décembre 2019. En Juin 2021, La pandémie à CoVID-19 a entraîné 176 Million de cas confirmés, dont 3,8 millions de décès dans le monde, elle a présenté des statistiques globales supérieures et incomparables à celles des épidémies de 2003 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS) (8273 cas, 775 décès) et de 2013 du syndrome respiratoire du Moyen-Orient (SRE) (1139 cas, 431 décès). L'Afrique subsaharienne est entrée dans la pandémie au début du mois de mars 2020. Bon nombre de ses pays se sont étroitement engagés dans les différentes stratégies de riposte contre la COVID-19. Ce contexte de pandémie a montré qu’une détection tardive des cas et des foyers d’infection, une méconnaissance de la vitesse de propagation, l'étendue spatiale élevée de l'épidémie et une réponse trop faible pendant la phase d'alerte pèsent lourdement sur la dynamique future de l'épidémie. Cette dynamique est mesurée et analysée en temps réel dans la plupart des pays d'Asie, d'Europe et d'Amérique, avec pour objectif de maitriser l'histoire naturelle de la maladie, sa pathogénie, son épidémiologie, ses facteurs de risque, l'efficacité des mesures barrières et les différentes stratégies de réponse pour ajuster les réponses nationales. Il est donc essentiel que les pays de l’Afrique Sub-Saharienne se dotent d'outils de suivi de l'épidémie. Pour répondre efficacement à la demande en soins de santé primaire et des hôpitaux de plus en plus importante, aux besoins des services de santé en équipements protecteurs et thérapeutiques afin de mieux maitriser la dynamique, d'anticiper toute évolution de l’épidémie et établir un système de surveillance des épidémies. Dans le cadre des systèmes de santé mis en place par les autorités sanitaires du Bénin et du Burkina Faso, le projet développera avec les utilisateurs visés un système de surveillance et de réponse aux épidémies qui sera efficace, sensible, coordonné et adapté à un contexte de faibles ressources. Le système de surveillance épidémiologique sera en mesure de produire et de traiter les informations continues nécessaires à l'alerte précoce et au contrôle de la réponse sanitaire. Le système d'information sera basé sur des enquêtes épidémiologiques de terrain et un dispositif de surveillance syndromique, des tests virologiques et des indicateurs qui permettent de suivre l'action, de contrôler l'adaptation à l'épidémie et de maîtriser les capacités de réponse des structures sanitaires. L'analyse des données collectées apportera des connaissances utiles pour mieux comprendre la dynamique de l'épidémie. Enfin, le projet encouragera la collaboration entre les chercheurs africains et européens et renforcera la capacité des institutions africaines à mettre en place un système de surveillance des épidémies.
Description des « Work packages »
WP1: Coordination
Le WP1 garantira une bonne harmonisation parmi les différents WP. L’objectif principal du WP1 est de surveiller l’implémentation et le progrès des activités du projet à temps et suivant le budget. Le WP1 est coordonné par le Dr. Achille Massougbodji (IRCB, Benin) et codirigé par Dr. Gilles Cottrell (IRD, France). Les objectives du WP sont :
- Coordonner l’implémentation et la progression des activités du projet.
- Garantir l’identification des risques et mesures de correction pour son atténuation.
- Faciliter une communication effective entre les partenaires.
- Garantir que toutes les activités d’investigation sont d’accord avec les procédures éthiques nationales et internationales.
WP2 : Surveillance épidémiologique du COVID-19
Le WP2 est dirigé par Dr. Gilles Cottrell (IRD) et co-dirigé par Dr. Emmanuel Bonnet (IRD). Les activités du WP2 représentent toutes les activités sur terrain, y compris la phase de préparation, la surveillance active (sur des hôpitaux, au Bénin) et surveillance clinque (sur des postes de santé, au Bénin et au Burkina Faso). Le WP2 surveillera l’harmonisation de chaque site d’étude et formera le personnel local. Les objectifs du WP sont :
- Établir un système de dépistage clinique et virologique, ainsi que pour identifier les contacts des individus diagnostiqués avec COVID-19.
- Surveiller la disponibilité des équipements de protection pour les agents de santé dans les hôpitaux et cliniques de santé, ainsi que l’apparition des symptômes de COVID-19, et identifier l’apparition de grappes des cas COVID-19 afin de proposer une réponse rapide pour contenir la propagation de l’épidémie.
- Étudier la perception de la pandémie du COVID-19 par la population et agents de santé sur les sites d’étude au Burkina Faso et au Bénin.
WP3 : Laboratoire et «capacity building»
Le WP3 est dirigé par Dr. Anges Yadouleton (Laboratoire national des Fièvres Hémorragiques, Bénin) et co-dirigé par Dr. Nadine Fievet (IRD). Dans le cadre de la surveillance active au Bénin, le WP3 garantit la collecte, le transport et le traitement correct des échantillons des individus suspectés d’être infectés avec SARS-CoV-2. Les échantillons des centres de référence désignés du projet seront collectés et transportés en respectant les démarches de sécurité et selon un programme défini afin de garantir la réception à temps des échantillons sur les laboratoires de diagnostic les plus proches des sites d’étude.
WP4 : Geo-epidémiologie et biostatistique
Le WP4 est dirigé par Dr. Jean Gaudart et co-dirigé par Dr. Emmanuel Bonnet (IRD). Ce WP mettra en œuvre des méthodes avancées adaptées spécifiquement pour l’analyse des maladies infectieuses afin de caractériser la courbe épidémique du SARS-CoV-2. Les objectifs de ce WP sont :
- Analyser la dynamique de la propagation du COVID-19 en communautés de faibles ressources et identifier des foyers de transmission.
- Identifier modèles de transmission basés sur la surveillance active (au Bénin) et clinique (au Burkina Faso et au Bénin).
- Analyser les facteurs associés à la transmission afin d’évaluer les modèles de transmission dans des populations plus larges et estimer l’efficacité des mesures de réponse.
WP5 : Gestion des données
Le WP5 est dirigé par Dr. Gilles Cottrell et co-dirigé par Dr. Jean Gaudart (IRD). Ce WP établira un système de collecte des données digitales efficace. Les objectifs de ce WP sont :
- Garantir un système de collecte des données digitales efficace sur le terrain.
- Réaliser le contrôle de qualité et tableaux de bord journaliers.
- Produire des bases de données pour la visualisation et analyse des données.
- Établir un système d’information digital pour la surveillance épidémiologique au Bénin et au Burkina Faso.
WP6 : « Networking » et Dissémination
Le WP6 est dirigé par Dr. Raquel González (ISGlobal). Ce WP contribuera à accomplir les objectifs du projet à travers la collaboration des partenaires Africains et Européens impliqués, ainsi qu’avec des autres parties intéressées qui participent à d’autres études sur le COVID-19. Les activités de « networking » seront horizontales et se produiront parmi les partenaires du projet et extérieurement avec d’autres consortium COVID-19. Les objectifs de ce WP sont :
- Établir un réseau entre des institutions de recherche européenes et africaines afin de pallier le manque de connaissances sur le COVID-19 en Afrique Sub-Saharienne.
- Promouvoir l’échange d’informations avec des institutions pertinentes.
- Améliorer l’interaction entre les scientifiques, institutions et responsables politiques pour une traduction effective des résultats pertinents en politiques et pratiques.
- Designer et implémenter des outils de communication.
- Disséminer des matériaux électroniques afin de garantir un message clair à une audience scientifique plus large en relation avec la progression du projet.
